Общение биологическое: Виды общения

Содержание

Как продуктивно учиться и работать в онлайн: какие трудности вызывает дистанционное общение

Размер шрифта

Межбуквенный интервал

Семейство шрифтов

Новость
2020
июня
09
Как продуктивно учиться и работать в онлайн: какие трудности вызывает дистанционное общение

09.06.2020

Дистанционные работа, учеба и общение — все еще реалии современной жизни. Пока ограничительные меры продолжают действовать, студенты и преподаватели взаимодействуют только через интернет. К каким трудностям это может привести и почему некоторые студенты и преподаватели проще свыклись с новой формой общения — рассказала заведующий кафедрой «Общая психология, психодиагностика и психологическое консультирование» Высшей медико-биологической школы ЮУрГУ, кандидат психологических наук Светлана Морозова.

Чем отличается реальное общение и общение в Сети?

«При общении в интернете образ человека создается даже до знакомства с ним, все благодаря возможности выложить в общий доступ любую информацию.
В реальности такой возможности зачастую нет. Зато можно обонять, тактильно ощущать другого человека — похлопать по плечу, пожать руку. Так что полностью заменить реальное общение виртуальным не получится».

Может ли при долгом общении в Сети измениться отношение к коммуникации в реальности?

«Особенности интернет-общения в том, что пользователь может легко осуществлять множество контактов с различными людьми, часто незнакомыми ему ранее, сменить множество вариантов общения. Реальный мир такую возможность не предоставляет. Исследования, которые доказывают, что при длительном виртуальном общении могут возникать измененные состояния сознания — мистические переживания, беспокойство, тревога. Если общаться в вымышленных альтернативных мирах, то возникает чувство и ощущение сказочной фантастической легкости перемещений, управление предметным миром. Как отмечают отечественные и зарубежные исследователи, постоянное общение в сети Интернет может приводить к формированию у пользователей дезатаптивной стратегии «ухода от реальности», стремление проводить все больше времени в виртуальном мире, в котором зачастую отсутствуют реальные проблемы и трудности».

Есть ли положительное влияние виртуального общения?

«Виртуальное общение может приводить к негативному воздействию на личность, когда у человека проявляется навязчивое, компульсивное желание быть в интернете, даже если в этом нет необходимости. При этом такое общение является благоприятной средой для проявления свойств и потенциалов личности, которые могут быть недоступны в реальном общении».

Фото: Светлана Морозова, канд.психол.наук, заведующий кафедрой «Общая психология, психодиагностика и психологическое консультирование»

И все же, как человеку проще общаться психологически — лично или через любые средства связи, как телефон или компьютер?

«В этом вопросе все упирается в конкретную личность. Если человек активен в социальных сетях и не видит проблем в таком общении, то ему будет комфортно вести коммуникацию дистанционно. В противном случае реальное общение будет восприниматься как более эффективное.
В последнее время на кафедре «Общая психология, психодиагностика и психологическое консультирование» студенты защитили несколько дипломных работ, посвященных изучению личности в социальных сетях. Можно выделить исследование «Ценностно-потребностная сфера молодежи с разной степенью интернет-активности».

К каким результатам пришли исследователи?

«Согласно полученным данным, молодежь с высокой интернет-активностью ценит хороших и верных друзей, любит деньги и предпочитает покупать хорошие вещи. Ценностью для нее являются друзья, стремится эта категория к красоте, а добиваться всего предпочитает честным путем. Людям этой категории важно обеспечить себе стабильность и безопасность, найти интересную работу. Информацию такая молодежь предпочитает искать в интернете, знакомясь с отзывами.
В то же время молодежь с низкой интернет-активностью нуждается в межличностном взаимодействии, стремясь найти в первую очередь хороших собеседников. Они достигают своих целей с помощью терпения и самоконтроля. Представители этой категории выбирают работу, для которой необходимы действия в реальной жизни. Главная их ценность — самореализация и здоровье. Такая молодежь стремится не к личному комфорту, а к счастью социального окружения, потому что лишь в таком случае им самим будет комфортно».

Как психологи относятся к усиливающемуся переходу в сторону интернет-общения?

«Являясь специфической сферой для самопрезентации и самоутверждения личности, интернет можно рассматривать как пространство для самоактуализации личности. Интернет-среда — это источник удовлетворения таких потребностей, как социальная идентичность, стремление к публичности, самопрезентация, доверие к партнерам по общению, избегание одиночества и общение. Чтобы удовлетворенные потребности способствовали развитию личности, а не аддиктивному поведению (то поведение, которое выражается в стремлении уйти из реальности посредством изменения своего психического состояния), человек должен рационально пользоваться виртуальными возможностями. Виртуальный мир должен дополнять, а не компенсировать реальную жизнь.

Поэтому задачей психологов является снижение стремления к публичности и самопрезентации за счет сохранения и развития социальной идентичности с реальным окружением. Если интернет сможет внушить доверие пользователю, то он станет для личности полезным инструментом, способствующему личностному развитию, а не аддиктивным способом ухода от реальности».

Дарья Цымбалюк, фото: pexels.com, архив С.В. Морозовой

Контактное лицо по новости:

Дарья Цымбалюк, тел: 272-30-11

Ограничение общения ребенка с отцом: порядок, помощь адвоката

Ни для кого не секрет, что когда супруги расторгают брачные отношения, неразрывно встает вопрос не только о разделе имущества, но и как бы это грубо не звучало, о «разделе» детей, которые, как правило, остаются жить с матерью.

Содержание статьи:

Сколько по закону отец имеет право видеться с ребенком?
Как доказать, что отец плохо влияет на ребенка?

Как ограничить общение ребенка с отцом?
Как запретить биологическому отцу видеться с ребенком?
Помощь адвоката об ограничении общения с ребенком

ВНИМАНИЕ: наш адвокат по семейным делам поможет в вопросе ограничение общения ребенка с отцом: профессионально, на выгодных условиях соглашения об оказании юридической помощи и в срок. Звоните прямо сегодня!

Сколько по закону отец имеет право видеться с ребенком?

В том случае, если бывшие супруги не имеют претензий друг к другу в данном отношении – его права не ограничены (статья 61 Семейного кодекса РФ). Но, если возникают соответствующие судебные споры – его права на общение с ребенком (детьми) ограничиваются судом.

Совет: настоятельно рекомендуем не прибегать к противоправным действиям – красть ребенка, досаждать матери и т.п., в противном случае, при судебном разбирательстве, указанные обстоятельства будут свидетельствовать против Вас.

Как доказать, что отец плохо влияет на ребенка?

Если при или после встреч с отцом ребенка не узнать – он капризничает, ведет себя не так, как обычно, нецензурно выражается – есть повод ограничить общение отца с ребенком. Но как это доказать? Безусловно, для этого нужны неопровержимые факты, а не догадки или подозрения матери, среди которых могут быть:

Свидетельские показания, в том числе близких родственников
Показания, данные психологом, работающим с ребёнком

Данные полученные органами опеки и попечительства о судимости отца (при наличии), приводах в полицию и т. п.
Данные о том, что отец ребенка не имеет в собственности или пользовании жилья, пригодного для нахождения в нем ребенка (по площади, состоянию и т.п.)
Факты доказывающие, что отец не здоров — туберкулез, гепатит, и т.п. Или состоит на учете у нарколога, психолога и тому подобное

В случае если судом уже установлен график общения с ребенком – данные о его регулярном нарушении. Эти обстоятельства могут или наносят психологические травмы ребенку.

Помимо вышеизложенного обратитесь к органам опеки. Попросите их провести беседу с отцом – этот факт будет зафиксирован. Также сотрудники органов опеки обследуют жилье отца, на предмет его соответствия потребностям ребенка. Обязательно привлеките их в качестве третьих лиц в судебный процесс, данные показания будут очень важны для Вас.

Кроме того, в рамках для подготовки к судебному разбирательству можно опросить самого ребенка, поинтересоваться, чем они занимаются во время встреч с отцом. Но! Такая беседа должна быть проведена психологом.

Суд, по своей инициативе, или по ходатайству лица, участвующего в деле также может опросить ребенка, спросить его мнение. Если ребенок старше 10 (десяти) лет, то его мнение будет иметь существенное значение при рассмотрении дела и, если у отца нет проблем с законом или здоровьем, то вряд-ли Вы сможете ограничить его в правах.

Важно: при подаче рассматриваемых исков государственная пошлина не уплачивается, подробнее об определении графика общения с ребенком по ссылке

Как ограничить общение ребенка с отцом?

Безусловно, после развода и отец и мать имеют равные права по отношению к своим детям. Однако далеко не редкость, когда они расстаются, имея плохие взаимоотношения, и хотят насолить друг другу, даже используя в этом общих детей.

К сожалению, если это просто желание, ничем не подкрепленное – ничего не получится.

Кроме того, ни семейным кодексом ни иными нормативными актами не установлен конкретный перечень оснований, по которым мать (или отец) могут ограничить бывшего супруга в общении с ребенком, не установлен. Но на практике рассмотрения аналогичных споров это могут быть основания изложенных в статье 69 СК РФ:

невыполнение обязательств по уплате алиментных платежей, в случае если они назначены судом, либо имеется соответствующее соглашение удостоверенное нотариально
насильственные действия в отношении детей (ребенка), в том числе психологического характера
нежелание (а точнее отказ) сопровождать ребенка в детские дошкольные, школьные, медицинские и иных учреждения, посещение которых необходимо для него

алкогольная или наркотическая зависимость
иные факты, свидетельствующие о невыполнении бывшим супругом родительских обязательств

Вышеперечисленные причины могут стать основанием не только для ограничения, но и для лишения бывшего супруга (супругу) родительских прав.

Кроме того если отец:

плохо влияет на ребенка
культивирует в нем жестокость, агрессивность, страсть к нездоровым увлечениям
отрицательно влияет на его обучение
прививает неуважение к старшим, к родственникам (в том числе мать)
игнорирует интересы матери, удерживает ребенка
и т. п.

Все вышеупомянутые обстоятельства также будут являться поводом для ограничения отца в общении с ребенком. Безусловно, сделать это можно только в судебном порядке, путем подачи соответствующего заявления.

ПОЛЕЗНО: читайте также про лишение родительских прав по ссылке

Как запретить биологическому отцу видеться с ребенком?

Опять же напомним, что все, что касается запретов, решается только судом. Если отец выполняет свои обязанности – содержит и воспитывает ребенка, лишить его отцовства Вы не сможете.

Запрет на общение или ограничение его родительских прав – такое решение может быть принято судом в случае, если:

общение с отцом психологически и/или физически отрицательно влияет на ребенка
родитель имеет заболевание (в том числе психологическое) которое представляет опасность для ребенка
отец болен алкоголизмом либо употребляет алкоголь в чрезмерных количествах, употребляет наркотики
общение с отцом представляет опасность для жизни и здоровья его и матери (даже в виде угроз)
не выполняется обязанность по уплате алиментов в течение более чем 6-ти месяцев. Однако препятствовать общению с ребенком на этом основании самостоятельно Вы не имеете права. Более того, данный факт может явиться основанием для отказа в удовлетворении требований о запрете на общение с ребенком

Подать заявление о запрете общения с ребенком может не только мать, но и иные близкие родственники, а также органы опеки и попечительства и иные учреждения, которые отвечают за здоровье детей (школы, детские сады и т.п.), прокурор.

По истечении 6-ти месяцев с момента введения ограничения (запрета) на встречи с ребенком, органы опеки имеют право обратиться в суд с иском о лишении родительских прав (в случае если обстоятельства послужившие основанием для ограничения не устранены). Указанное заявление может быть направлено ранее.

При рассмотрении судебного дела к участию в процессе привлекаются: прокурор и сотрудники опеки.

Помимо вышеизложенного в ходе судебного разбирательства решается вопрос об уплате алиментных обязательств. После вступления решения суда в законную силу оно направляется в ЗАГС по месту регистрации ребенка (судом).

Помощь адвоката об ограничении общения с ребенком

В судебных спорах связанных с правами ребенка Вам может понадобиться помощь адвоката по семейным делам. И мы с огромным удовольствием и не меньшим профессионализмом готовы оказать ее на любых стадиях разбирательств, начиная от консультации и заканчивая исполнением судебного акта.

В рассматриваемых судебных спорах очень важно собрать полную доказательную базу и на основании нее подготовить грамотное заявление в суд.

Не стоит пренебрегать этим советом, поскольку речь идет о ребенке, а бесстрастно защитить его права самостоятельно порой очень трудно.

Автор статьи:

А.В. Кацайлиди

Модель биологической коммуникации в нанофабрикате клетки-имитатора, управляемого стохастическим резонансом

[1] Doktycz MJ, Simpson ML. Синтетическая биология с использованием нанотехнологий. Мол Сист Биол. 2007; 3:125. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[2] Simpson ML, Cox CD, Peterson GD, Sayler GS. Инженерия в биологическом субстрате: обработка информации в генетических цепях. Труды IEEE. 2004; 92: 848–863. [Google Scholar]

[3] Накано Т., Шуай Дж., Коджин Т., Суда Т., Хираока Й., Харагути Т. Биологические возбудимые среды на основе невозбудимых клеток и передачи сигналов кальция. Нанокоммуникационные сети. 2010; 1:43–49. [Google Scholar]

[4] Хияма С., Моритани Ю. Молекулярная коммуникация: использование биохимических материалов для разработки биомиметических коммуникационных систем. Нанокоммуникационные сети. 2010;1:20–30. [Google Scholar]

[5] Fernandes R, Roy V, Wu HC, Bentley WE. Спроектированные биологические нанофабрики запускают реакцию чувства кворума у целевых бактерий. Нат Нано. 2010;5:213–217. [PubMed] [Google Scholar]

[6] Акилдиз И.Ф., Брунетти Ф., Бласкес С. Наносети: новая коммуникационная парадигма. Компьютерная сеть. 2008; 52: 2260–2279. [Google Scholar]

[7] Сандерсон М.Дж., Чарльз А.С., Бойтано С., Дирксен Э.Р. Механизмы и функции межклеточной передачи сигналов кальция. Молекулярная и клеточная эндокринология. 1994; 98: 173–187. [PubMed] [Google Scholar]

[8] Lyon GJ, Novick RP. Пептидная сигнализация у Staphylococcus aureus и других грамположительных бактерий. Пептиды. 2004; 25:1389–1403. [PubMed] [Google Scholar]

[9] Chen H, Fink GR. Обратная связь морфогенеза грибов ароматическими спиртами. Гены Дев. 2006; 20:1150–1161. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[10] Waters CM, Bassler BL. QUORUM SENSING: Межклеточная коммуникация в бактериях. Ежегодный обзор клеточной биологии и биологии развития. 2005; 21: 319–346. [PubMed] [Google Scholar]

[11] Winzer K, Falconer C, Garber NC, Diggle SP, Camara M, Williams P. Лектины Pseudomonas aeruginosa PA-IL и PA-IIL контролируются с помощью определения кворума и RpoS. J Бактериол. 2000;182:6401–6411. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[12] Brint JM, Ohman DE. Синтез множественных экзопродуктов у Pseudomonas aeruginosa находится под контролем RhlR-RhlI, другого набора регуляторов в штамме PAO1, гомологичного семейству LuxR-LuxI, чувствительному к аутоиндукторам. J Бактериол. 1995;177:7155–7163. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[13] Davies DG, Parsek MR, Pearson JP, Iglewski BH, Costerton JW, Greenberg EP. Участие межклеточных сигналов в развитии бактериальной биопленки. Наука. 1998; 280: 295–298. [PubMed] [Google Scholar]

[14] Hassett DJ, Ma JF, Elkins JG, McDermott TR, Ochsner UA, West SE, Huang CT, Fredericks J, Burnett S, Stewart PS, McFeters G, Passador L, Iglewski BH . Чувство кворума у Pseudomonas aeruginosa контролирует экспрессию генов каталазы и супероксиддисмутазы и опосредует восприимчивость биопленки к перекиси водорода. Мол микробиол. 1999;34:1082–1093. [PubMed] [Google Scholar]

[15] Вайс Р., Найт Т. Вычисления ДНК. Спрингер; Берлин/Гейдельберг: 2001. Инженерные коммуникации для микробной робототехники; стр. 1–16. [Google Scholar]

[16] Вайс Р., Басу С., Хушанги С., Калмбах А., Кариг Д., Мехрея Р., Нетравали И. Строительные блоки генетической схемы для клеточных вычислений, связи и обработки сигналов. Естественные вычисления. 2003; 2:47–84. [Google Scholar]

[17] Basu S, Karig D, Weiss R. Инженерная обработка сигналов в клетках: на пути к обнаружению полосы молекулярной концентрации. Естественные вычисления. 2003; 2: 463–478. [Академия Google]

[18] Basu S, Mehreja R, Thiberge S, Chen M-T, Weiss R. Пространственно-временной контроль экспрессии генов с помощью сетей, генерирующих импульсы. Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 2004; 101:6355–6360. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[19] Basu S, Gerchman Y, Collins CH, Arnold FH, Weiss R. Синтетическая многоклеточная система для запрограммированного формирования паттернов. Природа. 2005; 434:1130–1134. [PubMed] [Google Scholar]

[20] McMillen D, Kopell N, Hasty J, Collins JJ. Синхронизация осцилляторов генетической релаксации с помощью межклеточной сигнализации. Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 2002;99: 679–684. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[21] Данино Т., Мондрагон-Паломино О., Цимринг Л., Хасти Дж. Синхронизированный кворум генетических часов. Природа. 2010; 463:326–330. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[22] Whiteley M, Greenberg EP. Элементы специфичности промотора в генах, контролируемых определением кворума Pseudomonas aeruginosa. J Бактериол. 2001; 183:5529–5534. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[23] Кариг Д., Вайс Р. Генетическая схема с усилением сигнала позволяет наблюдать in vivo активацию слабого промотора в системе определения кворума Rhl. Биотехнология Биоинж. 2005;89: 709–718. [PubMed] [Google Scholar]

[24] Gray KM, Passador L, Iglewski BH, Greenberg EP. Взаимозаменяемость и специфичность компонентов регуляторных систем кворума Vibrio fischeri и Pseudomonas aeruginosa. J Бактериол. 1994; 176:3076–3080. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[25] Brenner K, Karig DK, Weiss R, Arnold FH. Спроектированная двунаправленная связь обеспечивает консенсус в консорциуме микробных биопленок. Proc Natl Acad Sci U S A. 2007;104:17300–17304. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[26] Balagadde FK, Song H, Ozaki J, Collins CH, Barnet M, Arnold FH, Quake SR, You L. Синтетическая экосистема хищник-жертва Escherichia coli. Мол Сист Биол. 2008; 4:187. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[27] Карлссон М., Дэвидсон М., Карлссон Р., Карлссон А., Бергенхольц Дж., Конколи З., Есорка А., Лобовкина Т., Хуртиг Дж., Воинова М., Орвар О. БИОМИМЕТИЧЕСКИЕ НАНОРАЗМЕРНЫЕ РЕАКТОРЫ И СЕТИ. Ежегодный обзор физической химии. 2004; 55: 613–649. [PubMed] [Академия Google]

[28] Vriezema DM, Comellas AragonÃs̈ M, Elemans JAAW, Cornelissen JJLM, Rowan AE, Nolte RJM. Самособирающиеся нанореакторы. Химические обзоры. 2005; 105:1445–1490. [PubMed] [Google Scholar]

[29] Вальде П., Итикава С. Ферменты внутри липидных пузырьков: подготовка, реактивность и применение. Биомолекулярная инженерия. 2001; 18: 143–177. [PubMed] [Google Scholar]

[30] Moritani Y, Hiyama S, Nomura SM, Akiyoshi K, Suda T. Коммуникационный интерфейс с использованием везикул, встроенных в белки, формирующие каналы, в молекулярной коммуникации; Биологические модели сетевых, информационных и вычислительных систем; 2007 г.; 2007. стр. 147–149.. Bionetics 2007. 2nd [Google Scholar]

[31] Moritani Y, Hiyama S, Suda T. Молекулярная связь между наномашинами с использованием везикул; НСТИ-Нанотех 2006; 2006. [Google Scholar]

[32] Джесорка А., Орвар О. Липосомы: технологии и аналитические приложения. Annu Rev Anal Chem (Пало-Альто, Калифорния) 2008; 1: 801–832. [PubMed] [Google Scholar]

[33] Monnard PA. Полимеразы, захваченные липосомами, как модели для микро/наномасштабных биореакторов. Журнал мембранной биологии. 2003;191:87–97. [PubMed] [Google Scholar]

[34] Перейра де Соуза Т., Стано П., Луизи П.Л. Минимальный размер модельных клеток на основе липосом приводит к значительному усилению захвата и синтеза белка. Химбиохим. 2009;10:1056–1063. [PubMed] [Google Scholar]

[35] Yu W, Sato K, Wakabayashi M, Nakaishi T, Ko-Mitamura EP, Shima Y, Urabe I, Yomo T. Синтез функционального белка в липосоме. J Biosci Bioeng. 2001; 92: 590–593. [PubMed] [Google Scholar]

[36] Номура С.М., Цумото К., Хамада Т., Акиёси К., Накатани Ю., Йошикава К. Экспрессия генов в липидных пузырьках размером с клетку. Химбиохим. 2003; 4: 1172–1175. [PubMed] [Академия Google]

[37] Исикава К., Сато К., Шима Ю., Урабе И., Йомо Т. Экспрессия каскадной генетической сети в липосомах. ФЭБС лат. 2004; 576: 387–390. [PubMed] [Google Scholar]

[38] Noireaux V, Bar-Ziv R, Godefroy J, Salman H, Libchaber A. На пути к искусственной клетке на основе экспрессии генов в везикулах. физ.-биол. 2005; 2: С1–8. [PubMed] [Google Scholar]

[39] Флетчер Б. Л., Халландер Э.Д., Мелечко А.В., Макнайт Т.Е., Кляйн К.Л., Хенсли Д.К., Моррелл Д.Л., Симпсон М.Л., Доктич М.Дж. Микроматрицы биомиметических клеток, сформированные контролируемым синтезом углеродных нановолоконных мембран. Нано буквы. 2004;4:1809–1814. [Google Scholar]

[40] Доктыч М.Дж., Флетчер Б.Л., Халландер Э.Д., Фаулкс Д.Д., Реттерер С.Т., Макнайт Т.Е., Мелечко А.В., Симпсон М.Л. Имитаторы клеток, созданные путем контролируемого синтеза и направленной сборки углеродных нановолокон; Конференция по биомикро и наносистемам, 2006. BMN ’06; 2006.стр. 13–13. [Google Scholar]

[41] Retterer ST, Siuti P, Choi C-K, Thomas DK, Doktycz MJ. Разработка и изготовление биореакторов на основе нанопористого кремния в составе микрофлюидного чипа. Лаборатория на чипе. 2010;10:1174–1181. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[42] Siuti P, Retterer ST, Chang Kyoung C, Fowlkes JD, Doktycz MJ. Бесклеточная трансляция в специально разработанных пиколитровых контейнерах; Конференция по биомедицинской науке и технике, 2009 г. ЧЭС 2009 г. Первый ежегодный ORNL; 2009.стр. 1–4. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[43] Симпсон М.Л., Кокс К.Д., Аллен М.С., Макколлум Дж.М., Дар Р.Д., Кариг Д.К., Кук Дж.Ф. Шум в биологических цепях. Wiley Interdiscip Rev Nanomed Nanobiotechnol. 2009; 1: 214–225. [PubMed] [Академия Google]

[44] Бьюик С., Ян Р., Чжан М. Сложные математические модели биологии в наномасштабе. Междисциплинарные обзоры Wiley: наномедицина и нанобиотехнология. 2009; 1: 650–659. [PubMed] [Google Scholar]

[45] Simpson ML, Cox CD, Sayler GS. Анализ частотной области шума в авторегулируемых генных цепях. Proc Natl Acad Sci U S A. 2003;100:4551–4556. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[46] Бекскей А., Серрано Л. Инженерная стабильность в генных сетях путем саморегуляции. Природа. 2000;405:590–593. [PubMed] [Google Scholar]

[47] Остин Д.В., Аллен М.С., Макколлум Дж.М., Дар Р.Д., Уилгус Дж.Р., Сайлер Г.С., Саматова Н.Ф., Кокс К.Д., Симпсон М. Л. Генная сеть, формирующая спектры собственных шумов. Природа. 2006; 439: 608–611. [PubMed] [Google Scholar]

[48] Blake WJ, Balazsi G, Kohanski MA, Isaacs FJ, Murphy KF, Kuang Y, Cantor CR, Walt DR, Collins JJ. Фенотипические последствия транскрипционного шума, опосредованного промотором. Мол Ячейка. 2006; 24:853–865. [PubMed] [Google Scholar]

[49] Вайнбергер Л.С., Дар Р.Д., Симпсон М.Л. Транзиторно-опосредованная детерминация судьбы в цепи транскрипции ВИЧ. Нат Жене. 2008; 40: 466–470. [PubMed] [Академия Google]

[50] Weinberger LS, Burnett JC, Toettcher JE, Arkin AP, Schaffer DV. Стохастическая экспрессия генов в лентивирусной петле положительной обратной связи: колебания Tat ВИЧ-1 определяют фенотипическое разнообразие. Клетка. 2005; 122:169–182. [PubMed] [Google Scholar]

[51] Ван З., Хоу З., Синь Х. Стохастический резонанс внутреннего шума синтетической генной сети. Письма по химической физике. 2005; 401:307–311. [Google Scholar]

[52] Hasty J, Dolnik M, Rottsch, auml, fer V, Collins JJ. Синтетическая генная сеть для обучения и усиления клеточных колебаний. Письма о физическом обзоре. 2002; 88:148101. [PubMed] [Академия Google]

[53] Wang Z, Hou Z, Xin H, Zhang Z. Спроектированный стохастический резонатор внутреннего шума в генной сети: модельное исследование. Биофизическая химия. 2007; 125: 281–285. [PubMed] [Google Scholar]

[54] Косеска А., Заикин А., Куртс Дж., Гарсия-Охалво Дж. Синхронизация принятия решений сотовой связью в условиях шума с помощью межсотовой связи. ПЛОС ОДИН. 2009;4:e4872. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[55] McDonnell MD, Abbott D. Что такое стохастический резонанс? Определения, заблуждения, дебаты и их отношение к биологии. PLoS Comput Biol. 2009 г.;5:e1000348. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[56] Benzi R, et al. Механизм стохастического резонанса. Журнал физики A: математический и общий. 1981;14:L453. [Google Scholar]

[57] Шустер М., Урбановски М.Л., Гринберг Э.П. Специфичность промотора в определении кворума Pseudomonas aeruginosa, выявленная путем связывания ДНК очищенного LasR. Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 2004; 101:15833–15839. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[58] Кариг Д., к.т.н. Тезис. Университет Принстон; 2007. Разработка многосигнальных синтетических биологических систем. [Google Scholar]

[59] Shin J, Noireaux V. Эффективная бесклеточная экспрессия с эндогенной РНК-полимеразой E. Coli и сигма-фактором 70. Journal of Biological Engineering. 2010;4:8. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[60] Zhang Y, Hu G, Gammaitoni L. Передача сигнала в бистабильных системах с односторонней связью: шумовой эффект. Физический обзор E. 1998;58:2952. [Google Scholar]

[61] Gillespie DT. Химическое уравнение Ланжевена. Журнал химической физики. 2000; 113: 297–306. [Google Scholar]

[62] Озбудак Э.М., Таттай М., Курцер И., Гроссман А.Д., ван Ауденарден А. Регуляция шума в экспрессии одного гена. Нат Жене. 2002; 31: 69–73. [PubMed] [Google Scholar]

[63] Радж А., ван Ауденарден А. Природа, воспитание или случайность: стохастическая экспрессия генов и ее последствия. Клетка. 2008; 135: 216–226. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[64] Мерфи К.Ф., Адамс Р.М., Ван Х., Балази Г., Коллинз Дж.Дж. Настройка и контроль шума экспрессии генов в синтетических генных сетях. Нуклеиновые Кислоты Res. 2010;38:2712–2726. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[65] Dar RD, Karig DK, Cooke JF, Cox CD, Simpson ML. Распределение и регуляция стохастичности и пластичности у Saccharomyces cerevisiae. Хаос: междисциплинарный журнал нелинейной науки. 2010;20:037106. [PubMed] [Google Scholar]

[66] Choi PJ, Cai L, Frieda K, Xie XS. Стохастическое событие с одной молекулой запускает переключение фенотипа бактериальной клетки. Наука. 2008; 322:442–446. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[67] Биалек В. Стабильность и шум в биохимических переключателях. В: Лин Т., Диттерих Т., Тресп В., редакторы. Достижения в области обработки нейронной информации. Том. 13. Массачусетский технологический институт Пресс; Cambridge: 2001. [Google Scholar]

[68] Маркевич Н.И., Хук Ю.Б., Холоденко Б.Н. Сигнальные переключатели и бистабильность, возникающие в результате многосайтового фосфорилирования в каскадах протеинкиназ. Джей Селл Биол. 2004; 164: 353–359. [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[69] Win MN, Smolke CD. Обработка клеточной информации высшего порядка с помощью синтетических РНК-устройств. Наука. 2008; 322: 456–460. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[70] Симпсон МЛ. Бесклеточная синтетическая биология: восходящий подход к открытиям по замыслу. Мол Сист Биол. 2006;2 [бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[71] Rinaudo K, Bleris L, Maddamsetti R, Subramanian S, Weiss R, Benenson Y. Универсальный логический анализатор на основе РНК-интерференции, работающий в клетках млекопитающих. . Нат Биотех. 2007; 25: 795–801. [PubMed] [Google Scholar]

[72] Ким Дж., Уайт К. С., Уинфри Э. Создание бистабильной цепи in vitro из синтетических переключателей транскрипции. Мол Сист Биол. 2006; 2:68. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[73] Кариг Д.К., Симпсон М.Л. Завязывание новых узлов в синтетической биологии. HFSP J. 2008; 2: 124–128. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[74] Simpson ML, Cox CD, Sayler GS. Химический анализ Ланжевена в частотной области стохастичности в регуляции транскрипции генов. Журнал теоретической биологии. 2004; 229: 383–394. [PubMed] [Google Scholar]

[75] Бензи Р., Паризи Г., Сутера А., Вульпиани А. Теория стохастического резонанса в климатических изменениях. Журнал SIAM по прикладной математике. 1983;43:565–578. [Google Scholar]

[76] Мосс Ф., Уорд Л.М., Саннита В.Г. Стохастический резонанс и сенсорная обработка информации: учебник и обзор применения. Клин Нейрофизиол. 2004; 115: 267–281. [PubMed] [Google Scholar]

[77] Хоу З., Синь Х. Стохастический резонанс внутреннего шума в системе циркадных часов. Журнал химической физики. 2003; 119:11508–11512. [Google Scholar]

[78] Ханги П. Стохастический резонанс в биологии. Как шум может улучшить обнаружение слабых сигналов и помочь улучшить обработку биологической информации. Химфиз. 2002; 3: 285–29.0. [PubMed] [Google Scholar]

[79] Huang JJ, Petersen A, Whiteley M, Leadbetter JR. Идентификация QuiP, продукта гена PA1032, в качестве второй ацил-гомосеринлактон-ацилазы Pseudomonas aeruginosa PAO1. заявл. Окружающая среда. микробиол. 2006;72:1190–1197. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[80] Huang JJ, Han J-I, Zhang L-H, Leadbetter JR. Использование сигналов кворума ацил-гомосеринлактона для роста почвенной псевдомонадой и синегнойной палочкой PAO1. заявл. Окружающая среда. микробиол. 2003;69: 5941–5949. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[81] Dong Y-H, Wang L-H, Xu J-L, Zhang H-B, Zhang X-F, Zhang L-H. Тушение бактериальной инфекции, зависящей от чувства кворума, с помощью N-ацилгомосеринлактоназы. Природа. 2001; 411:813–817. [PubMed] [Google Scholar]

[82] Shin J, Noireaux V. Изучение инактивации матричной РНК и деградации белка в бесклеточной экспрессионной системе Escherichia coli. J Biol Eng. 2010;4:9. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

[83] Zhang Y, Zhang J, Hara H, Kato I, Inouye M. Взгляд на механизм расщепления мРНК с помощью MazF, мРНК-интерферазы. Дж. Биол. Хим. 2005; 280:3143–3150. [PubMed] [Google Scholar]

[84] Gottesman S, Roche E, Zhou Y, Sauer RT. Протеазы ClpXP и ClpAP расщепляют белки с карбоксиконцевыми пептидными хвостами, добавленными системой SsrA-мечения. Гены и развитие. 1998; 12:1338–1347. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

Биологическая коммуникация в многомасштабных сетях

Медицина биорегуляторных систем охватывает сложность биологических сетей при лечении болезней.

Сложность динамических биологических систем дает критическое представление о поведении и свойствах потока и регуляции биологической информации. Биологические сети по своей природе динамичны и нестабильны; их способность адаптироваться к постоянно меняющимся внутренним и внешним воздействиям определяется и диктуется их надежностью. Надежность сети относится к идее о том, что сети поглощают входные данные из своей среды, которые одновременно вызывают многочисленные регулятивные действия, чтобы поддерживать состояние динамического равновесия. Система считается надежной, если она сохраняет свою функцию независимо от того, в каком устойчивом состоянии или состоянии она находится.

Существует два основных типа биологической информации:

Информация о последовательности:

Информация о последовательности кодируется 4-значным нуклеотидным кодом в ДНК и определяет структурные и функциональные особенности белков и молекул РНК, составляющих молекулярные механизмы.

Регуляторная сетевая информация, контролирующая поведение молекулярных машин:

Информация о регуляторной сети проявляется в виде специфических взаимосвязанных предсказуемых взаимодействий между различными белками, другими молекулами и регуляторными элементами ДНК, которые описывают поведение молекулярных механизмов в том или ином клеточном состоянии. В этом смысле регуляторная сетевая информация связывает различные уровни биологической структуры, от молекул к клеткам, от клеток к тканям и от тканей к органам и системам органов.

Предполагается, что заболевание возникает, когда накопленные стрессы преобладают над способностями саморегуляции, поддерживающими устойчивость тканевых молекулярных сетей, что приводит к дисфункции тканей и, в свою очередь, к искажению потока молекулярной информации. Поскольку ткани и органы объединены в сети функциональными взаимозависимостями, искажения потока информации могут распространяться по сети, постепенно приводя к прогрессированию заболевания.

Ткани рассматриваются как биологические сети молекул и клеток, которые реагируют на различные внешние и внутренние факторы стресса, сохраняя при этом молекулярную когерентность. Молекулярная когерентность в этом контексте описывается как поведение молекул в ткани в ответ на сети молекул в других тканях или в большом круге кровообращения.